Sequence and secondary structure for 6VSB chain C

1 MFVFLVLLPL VSSQCVNLTT RTQLPPAYTN SFTRGVYYPD KVFRSSVLHS
                              EE E S     SS S B  S EEE 
51 TQDLFLPFFS NVTWFHAIHV SGTNGTKRFD NPVLPFNDGV YFASTEKSNI
EEEEE  TTE EE  B                    B  TT E EEEE       
101 IRGWIFGTTL DSKTQSLLIV NNATNVVIKV CEFQFCNDPF LGVYYHKNNK
   EEEESSS SSSS EEEEE E SSSEEEE        SS              
151 SWMESEFRVY SSANNCTFEY VSQPFLMDLE GKQGNFKNLR EFVFKNIDGY
       TT     TT   EE EE                EEE EEEEEEETTE 
201 FKIYSKHTPI NLVRDLPQGF SALEPLVDLP IGINITRFQT LLALHRSYLT
EEEEEEEEE     SS   S     EEEE  B       EEEE            
251 PGDSSSGWTA GAAAYYVGYL QPRTFLLKYN ENGTITDAVD CALDPLSETK
               EEE    EEEEEEEEE  TTS EEEEEE TTT HHHHHH 
301 CTLKSFTVEK GIYQTSNFRV QPTESIVRFP NITNLCPFGE VFNATRFASV
HHHTSS   S EEEEEEEEE     S   B   S   B   HH HHS S   BG 
351 YAWNRKRISN CVADYSVLYN SASFSTFKCY GVSPTKLNDL CFTNVYADSF
GG EEEEE S EE   HHHHH STT SEEEEE SS GGGGGG   BSEEEEEEE 
401 VIRGDEVRQI APGQTGKIAD YNYKLPDDFT GCVIAWNSNN LDSKVGGNYN
EEESGGGGGS STT  SHHHH HT    SS E EEEEEEE TT TT         
451 YLYRLFRKSN LKPFERDIST EIYQAGSTPC NGVEGFNCYF PLQSYGFQPT
EEE          SS                             S EEE      
501 NGVGYQPYRV VVLSFELLHA PATVCGPKKS TNLVKNKCVN FNFNGLTGTG
   TT EEEE EEEEEE SSS S  EE          SSSEEE EEETTEEEEE 
551 VLTESNKKFL PFQQFGRDIA DTTDAVRDPQ TLEILDITPC SFGGVSVITP
EEEE  S    TT   BBSST T B EEE TT T  EEEEE    EEEEEEEES 
601 GTNTSNQVAV LYQDVNCTEV PVAIHADQLT PTWRVYSTGS NVFQTRAGCL
 SSS S  EE EEET  TT                          EEE SSEEE 
651 IGAEHVNNSY ECDIPIGAGI CASYQTQTNS PGSASSVASQ SIIAYTMSLG
ES EE SS B   SSEEETTE E                  SS S EEEEB  S 
701 AENSVAYSNN SIAIPTNFTI SVTTEILPVS MTKTSVDCTM YICGDSTECS
 B      SS EEEEEEEEEE EEEEEEEE     EEEE HHH HHTSS HHHH 
751 NLLLQYGSFC TQLNRALTGI AVEQDKNTQE VFAQVKQIYK TPPIKDFGGF
HHHGGG SHH HHHHHHHHHH HHHHHHHHHH HH   SS      SS  STT  
801 NFSQILPDPS KPSKRSFIED LLFNKVTLAD AGFIKQYGDC LGDIAARDLI
  TTTSB TT      BHHHH HHHTT                            
851 CAQKFNGLTV LPPLLTDEMI AQYTSALLAG TITSGWTFGA GAALQIPFAM
     SSEEE E  SS HHHH HHHHHHHHHH HHHTGGGTTT SS     HHH 
901 QMAYRFNGIG VTQNVLYENQ KLIANQFNSA IGKIQDSLSS TASALGKLQD
HHHHHHHHHT   THHHHHTH HHHHHHHHHH HHHHHHHHHH SSSTTHHHHH 
951 VVNQNAQALN TLVKQLSSNF GAISSVLNDI LSRLDPPEAE VQIDRLITGR
HHHHHHHHHH HHHHGGG  T TSS S HHHH HHTS HHHHH HHHHHHHHHH 
1001 LQSLQTYVTQ QLIRAAEIRA SANLAATKMS ECVLGQSKRV DFCGKGYHLM
HHHHHHHHHH HHHHHHHHHH HHHHHHHHHH HHTSS   ST TSSSSSEEEE 
1051 SFPQSAPHGV VFLHVTYVPA QEKNFTTAPA ICHDGKAHFP REGVFVSNGT
EEEE  SSEE EEEEEEEEEE EEEEEEEES  EEETTEEEEE SSSEEEE SS 
1101 HWFVTQRNFY EPQIITTDNT FVSGNCDVVI GIVNNTVYDP LQPELDSFKE
 EEEE TTS       BTTTE EEEEESSSST T EE   B T TGGG       
1151 ELDKYFKNHT SPDVDLGDIS GINASVVNIQ KEIDRLNEVA KNLNESLIDL
                                                       
1201 QELGKYEQGS GYIPEAPRDG QAYVRKDGEW VLLSTFLGRS LEVLFQGPGH
                                                       
1251 HHHHHHHSAW SHPQFEKGGG SGGGGSGGSA WSHPQFEK