7L02

Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 2P S ectodomain bound to one copy of domain-swapped antibody 2G12

WebGL does not seem to be available.

This can be caused by an outdated browser, graphics card driver issue, or bad weather. Sometimes, just restarting the browser helps. Also, make sure hardware acceleration is enabled in your browser.

For a list of supported browsers, refer to http://caniuse.com/#feat=webgl.

Welcome
RCSB PDB Mol* Viewer 2.11.2 [1/27/2025, 4:56:27 PM]
Sequence of
27   ​A​​Y​​T​​N​​S​​F​​T​​R​​G​​V​37   ​Y​​Y​​P​​D​​K​​V​​F​​R​​S​​S​47   ​V​​L​​H​​S​​T​​Q​​D​​L​​F​​L​57   ​P​​F​​F​​S​​N​​V​​T​​W​​F​​H​67   ​A​​I​​H​​V​​S​​G​​T​​N​​G​​T​     ​K​​R​​F​​D​​N​​P​​V​​L​​P​​F​87   ​N​​D​​G​​V​​Y​​F​​A​​S​​T​​E​97   ​K​​S​​N​​I​​I​​R​​G​​W​​I​​F​107  ​G​​T​​T​​L​​D​​S​​K​​T​​Q​​S​117  ​L​​L​​I​​V​​N​​N​​A​​T​​N​​V​127  ​V​​I​​K​​V​​C​​E​​F​​Q​​F​​C​137  ​N​​D​​P​​F​​L​​G​​V​​Y​​Y​​H​     ​K​​N​​N​​K​​S​​W​​M​​E​​S​​E​     ​F​​R​​V​​Y​​S​​S​​A​​N​​N​​C​167  ​T​​F​​E​​Y​​V​​S​​Q​​P​​F​​L​     ​M​​D​​L​​E​​G​​K​​Q​​G​​N​​F​187  ​K​​N​​L​​R​​E​​F​​V​​F​​K​​N​197  ​I​​D​​G​​Y​​F​​K​​I​​Y​​S​​K​207  ​H​​T​​P​​I​​N​​L​​V​​R​​D​​L​217  ​P​​Q​​G​​F​​S​​A​​L​​E​​P​​L​227  ​V​​D​​L​​P​​I​​G​​I​​N​​I​​T​237  ​R​​F​​Q​​T​​L​​L​​A​​L​​H​​R​     ​S​​Y​​L​​T​​P​​G​​D​​S​​S​​S​     ​G​​W​​T​​A​​G​​A​​A​​A​​Y​​Y​267  ​V​​G​​Y​​L​​Q​​P​​R​​T​​F​​L​277  ​L​​K​​Y​​N​​E​​N​​G​​T​​I​​T​287  ​D​​A​​V​​D​​C​​A​​L​​D​​P​​L​297  ​S​​E​​T​​K​​C​​T​​L​​K​​S​​F​307  ​T​​V​​E​​K​​G​​I​​Y​​Q​​T​​S​317  ​N​​F​​R​​V​​Q​​P​​T​​E​​S​​I​327  ​V​​R​​F​​P​​N​​I​​T​​N​​L​​C​337  ​P​​F​​G​​E​​V​​F​​N​​A​​T​​R​347  ​F​​A​​S​​V​​Y​​A​​W​​N​​R​​K​357  ​R​​I​​S​​N​​C​​V​​A​​D​​Y​​S​367  ​V​​L​​Y​​N​​S​​A​​S​​F​​S​​T​377  ​F​​K​​C​​Y​​G​​V​​S​​P​​T​​K​387  ​L​​N​​D​​L​​C​​F​​T​​N​​V​​Y​397  ​A​​D​​S​​F​​V​​I​​R​​G​​D​​E​407  ​V​​R​​Q​​I​​A​​P​​G​​Q​​T​​G​417  ​K​​I​​A​​D​​Y​​N​​Y​​K​​L​​P​427  ​D​​D​​F​​T​​G​​C​​V​​I​​A​​W​437  ​N​​S​​N​​N​​L​​D​​S​​K​​V​​G​447  ​G​​N​​Y​​N​​Y​​L​​Y​​R​​L​​F​     ​R​​K​​S​​N​​L​​K​​P​​F​​E​​R​467  ​D​​I​​S​​T​​E​​I​​Y​​Q​​A​​G​     ​S​​T​​P​​C​​N​​G​​V​​E​​G​​F​     ​N​​C​​Y​​F​​P​​L​​Q​​S​​Y​​G​497  ​F​​Q​​P​​T​​N​​G​​V​​G​​Y​​Q​507  ​P​​Y​​R​​V​​V​​V​​L​​S​​F​​E​517  ​L​​L​​H​​A​​P​​A​​T​​V​​C​​G​527  ​P​​K​​K​​S​​T​​N​​L​​V​​K​​N​537  ​K​​C​​V​​N​​F​​N​​F​​N​​G​​L​547  ​T​​G​​T​​G​​V​​L​​T​​E​​S​​N​557  ​K​​K​​F​​L​​P​​F​​Q​​Q​​F​​G​567  ​R​​D​​I​​A​​D​​T​​T​​D​​A​​V​577  ​R​​D​​P​​Q​​T​​L​​E​​I​​L​​D​587  ​I​​T​​P​​C​​S​​F​​G​​G​​V​​S​597  ​V​​I​​T​​P​​G​​T​​N​​T​​S​​N​607  ​Q​​V​​A​​V​​L​​Y​​Q​​D​​V​​N​617  ​C​​T​​E​​V​​P​​V​​A​​I​​H​​A​     ​D​​Q​​L​​T​​P​​T​​W​​R​​V​​Y​     ​S​​T​​G​​S​​N​​V​​F​​Q​​T​​R​647  ​A​​G​​C​​L​​I​​G​​A​​E​​H​​V​657  ​N​​N​​S​​Y​​E​​C​​D​​I​​P​​I​667  ​G​​A​​G​​I​​C​​A​​S​​Y​​Q​​T​     ​Q​​T​​N​​S​​P​​R​​R​​A​​R​​S​     ​V​​A​​S​​Q​​S​​I​​I​​A​​Y​​T​697  ​M​​S​​L​​G​​A​​E​​N​​S​​V​​A​707  ​Y​​S​​N​​N​​S​​I​​A​​I​​P​​T​717  ​N​​F​​T​​I​​S​​V​​T​​T​​E​​I​727  ​L​​P​​V​​S​​M​​T​​K​​T​​S​​V​737  ​D​​C​​T​​M​​Y​​I​​C​​G​​D​​S​747  ​T​​E​​C​​S​​N​​L​​L​​L​​Q​​Y​757  ​G​​S​​F​​C​​T​​Q​​L​​N​​R​​A​767  ​L​​T​​G​​I​​A​​V​​E​​Q​​D​​K​777  ​N​​T​​Q​​E​​V​​F​​A​​Q​​V​​K​787  ​Q​​I​​Y​​K​​T​​P​​P​​I​​K​​D​797  ​F​​G​​G​​F​​N​​F​​S​​Q​​I​​L​807  ​P​​D​​P​​S​​K​​P​​S​​K​​R​​S​817  ​F​​I​​E​​D​​L​​L​​F​​N​​K​​V​827  ​T​​L​​A​​D​​A​​G​​F​​I​​K​​Q​     ​Y​​G​​D​​C​​L​​G​​D​​I​​A​​A​     ​R​​D​​L​​I​​C​​A​​Q​​K​​F​​N​857  ​G​​L​​T​​V​​L​​P​​P​​L​​L​​T​867  ​D​​E​​M​​I​​A​​Q​​Y​​T​​S​​A​877  ​L​​L​​A​​G​​T​​I​​T​​S​​G​​W​887  ​T​​F​​G​​A​​G​​A​​A​​L​​Q​​I​897  ​P​​F​​A​​M​​Q​​M​​A​​Y​​R​​F​907  ​N​​G​​I​​G​​V​​T​​Q​​N​​V​​L​917  ​Y​​E​​N​​Q​​K​​L​​I​​A​​N​​Q​927  ​F​​N​​S​​A​​I​​G​​K​​I​​Q​​D​937  ​S​​L​​S​​S​​T​​A​​S​​A​​L​​G​947  ​K​​L​​Q​​D​​V​​V​​N​​Q​​N​​A​957  ​Q​​A​​L​​N​​T​​L​​V​​K​​Q​​L​967  ​S​​S​​N​​F​​G​​A​​I​​S​​S​​V​977  ​L​​N​​D​​I​​L​​S​​R​​L​​D​​P​987  ​P​​E​​A​​E​​V​​Q​​I​​D​​R​​L​997  ​I​​T​​G​​R​​L​​Q​​S​​L​​Q​​T​1007 ​Y​​V​​T​​Q​​Q​​L​​I​​R​​A​​A​1017 ​E​​I​​R​​A​​S​​A​​N​​L​​A​​A​1027 ​T​​K​​M​​S​​E​​C​​V​​L​​G​​Q​1037 ​S​​K​​R​​V​​D​​F​​C​​G​​K​​G​1047 ​Y​​H​​L​​M​​S​​F​​P​​Q​​S​​A​1057 ​P​​H​​G​​V​​V​​F​​L​​H​​V​​T​1067 ​Y​​V​​P​​A​​Q​​E​​K​​N​​F​​T​1077 ​T​​A​​P​​A​​I​​C​​H​​D​​G​​K​1087 ​A​​H​​F​​P​​R​​E​​G​​V​​F​​V​1097 ​S​​N​​G​​T​​H​​W​​F​​V​​T​​Q​1107 ​R​​N​​F​​Y​​E​​P​​Q​​I​​I​​T​1117 ​T​​D​​N​​T​​F​​V​​S​​G​​N​​C​1127 ​D​​V​​V​​I​​G​​I​​V​​N​​N​​T​1137 ​V​​Y​​D​​P​​L​​Q​​P​​E​​L​​D​1147 ​S​
Type
Asm Id
Dynamic Bonds

Select a different viewer